这部意境大漠孤烟，英雄儿女的电影，在开拍之前遭遇了黑社会的威胁，险些不能与观众见面。
吴思远拿到版权之后，很快就遭到黑社会的威胁。
这个人就是蔡子明，是李连杰的经纪人。
当时，蔡子明看中了《新龙门客栈》，并且说不论怎么样他都拍定了，并且定下了演员。
李连杰饰演周淮安、杨紫琼饰演邱莫言、莫少聪饰演曹少钦。
有一天，蔡子明约吴思远在香港的丽晶酒店见面。
他和吴思远说，“我已经在银川搭好外景了，你要转让给我，你同意也行，不同意也行，反正我是要拍了。”
这的确把吴思远吓了一跳。
双方正在拉锯战的时候，1992年4月16日，38岁的蔡子明在停车场，被乱枪打死。
随着蔡子明被人枪杀，李连杰远走出去避风头。
吴思远才可以继续拍摄《新龙门客栈》
宦官专权的明朝中叶，东厂曹少钦（甄子丹）假造圣旨杀害了忠良杨宇轩，并想斩草除根杀死其后代。侠女邱莫言（林青霞）、江湖义士贺虎等人冒死救出忠良后代后，逃至边关沙漠里的龙门客栈，与杨宇轩部下周淮安（梁家辉）会合。龙门客栈实则黑店，老板娘金镶玉（张曼玉）利用乱世，以美貌和风骚 作诱饵杀人越货聚敛钱财，但她却为英俊潇洒的周淮安动了真心。为了摸清潜藏于龙门客栈中的出关暗道，周淮安将计就计，答应与金镶玉成亲。
洞房花烛夜，楼上的周淮安与金镶玉各怀心事暗中较劲，楼下的邱莫言、贺虎等人也与东厂一众“走狗”展开了明争暗斗，战事一触即发。