故事发生在明朝末年，大将军戚继光和兵部尚书戚继宇联手组成戚家军，对胆敢侵犯国土的倭寇迎头痛击。倭寇首领大岛正雄和朝中司礼大太监童大宝（于承惠 饰）内外勾结，陷害戚继宇，导致戚家军解散，戚家遭到了满门抄斩，作为戚家唯一的后代，戚少正（吴京 饰）不得不踏上了逃亡的旅途。
少林寺方丈至一（王珏 饰）将戚少正收为徒弟，童大宝得知了戚少正的下落，火烧少林，至一为了保护戚少正不幸身亡。之后，戚少正带着至一的血书前往南少林投奔圆照方丈（徐向东 饰），并先后结识了小妮（法提麦·雅琦 饰）、红莲和华子等人。血气方刚的一行年轻人，打算凭借他们自己的力量，重建戚家军。
大结局:法正还俗 有情人终成眷属
决战迫在眉睫,大岛正雄却上山与少林方丈切磋茶道棋艺,方丈知其来意,处处点拨,希望化解这一场大战,但大岛正雄主意已定,率队攻上南少林。
结局是：释小龙扮演的男主角杨恕联手已经断了一条胳膊的结拜大哥杀死反叛作乱的宁王朱宸豪。实际上他们两个联手也打不过宁王，但宁王顾及兄弟情义才被反杀的。
欧女是寨族长的千金小姐，对阿螺情有独钟，但两人门不当户不对难成眷属。倭寇杀进山寨后被鬼四郎掳走，所幸被河野华子所救。二人一见如故结为姐妹，为了了却华子心愿，鸥女让华子女扮男装前往南少林。
欧女是个忠贞刚烈、武功高强的侠女吧，最后为保住贞洁跳崖了
倭寇血洗曾家寨，欧女大战倭寇，最终跳海身亡，少林武僧来晚了。