现有82个专科分会,主要的有全科医学分会，眼科学分会，核医学分会，皮肤性病学分会，教育技术分会，放射学会，消化病学分会，检验分会，急诊医学分会，病理学分会，手外科分会，烧伤分会，变态反应学会，教育技术分会等等。
中华医学会不属于卫生局。它是中国医学科学技术工作者自愿组成并依法登记成立的学术性、公益性、非营利性法人社团，是党和国家联系医学科技工作者的桥梁和纽带，是发展中国医学科学技术事业的重要社会力量。
下属分会
儿童保健分会
妇女保健分会
中华预防医学会职业病专业委员会
中华预防医学会微生态学分会
中华预防医学会卫生事业管理分会
中华预防医学会卫生统计专业委员会
中华预防医学会食品卫生分会
中华预防医学会生物制品分会
中华预防医学会慢性病预防与控制分会
中华预防医学会口腔卫生保健专业委员会
中华预防医学会环境卫生分会
中华预防医学会卫生防疫管理分会
中华预防医学会初级卫生保健分会
中华预防医学会媒介生物学及控制分会
中华预防医学会流行病学分会
中华预防医学会劳动卫生与职业病分会
中华预防医学会医院感染控制分会
中华预防医学会儿少卫生分会
中华预防医学会消毒分会
分支机构
中华预防医学会总部设在北京，目前有单位会员1486个，超过11万名会员，其中专科会员10000多名。
中国各省、自治区、直辖市、计划单列市及一些市、县均成立了预防医学会，预防医学会的网络体系已遍布全国。
中华预防医学会机关设在北京。办事机构设有综合协调部、学会学术部、报刊管理部、对外联络部与项目办公室、继续教育与科普宣教部、科技评审部、科技服务部、信息服务部、规划财务部和期刊编辑部等。
中华预防医学会目前下设46个分支机构，即46个分会、专业委员会，涵盖了预防医学和保健领域的各专业。