东京决战一年后，失去记忆的鲁路修在11区（原日本国）过着平凡的学生生活。在鲁路修与弟弟罗洛的一次出行时，遇到了黑色骑士团的余党。在与少女C.C再次结成契约之后，尘封的记忆摆在了鲁路修的面前。
恢复记忆的鲁路修，为了建立人人平等的世界、让妹妹娜娜莉幸福的世界，而使用GEASS，令人绝对服从的力量，化名ZERO带领黑色骑士团向帝国宣战。
现在的鲁路修不仅要面对帝国的强大军事力量，更要面对虚假的弟弟罗洛、失踪的妹妹娜娜莉、不知敌友的中华联盟、内部出现分歧的黑色骑士团。面对内忧外患，鲁路修走上了GEASS之力的诅咒——孤独的王之路。
玛丽安娜·VI·布里塔尼亚: 皇历1997年，时年仅17岁（第二季确是如此设定，与第一季时间有冲突）的玛丽安娜与C.C携手，驰骋于疆场之上。二人与V.V相识，并且关系融洽。当时身为第六骑士的她，在针对绡鲁鲁皇帝的“血之纹章叛乱”中，与时为第五骑士的俾斯麦·巴鲁特施因特（即后来的第一骑士）携手保卫绡鲁鲁皇帝，亲手斩杀叛乱的第一骑士。事件之后，绡鲁鲁·G·不列颠皇帝陛下迎娶了身为圆桌骑士的玛丽安娜（见官方小说）。 但玛莉安娜拥有“跨越人心之力（让灵魂寄宿于其他的肉体之上）”的Geass，在遭到V.V.枪击后，利用肉体因濒临死亡而对Gease能力束缚减弱的机会第一次发动该能力，将灵魂寄宿在目睹一切的见习宫女阿尼亚体内。为了防止娜娜莉被V.V.灭口，玛丽安娜王妃建议绡鲁鲁皇帝封印娜娜莉的双眼，将其与皇兄鲁路修一同送往日本作为人质，以远离真相，让V.V.安心而不采取行动。 平时玛丽安娜潜藏在阿尼亚的深层意识之中，一旦她将意识移动到表层之后，便能支配阿尼亚的身体，与C.C.进行心灵对话。而皇帝也改变了阿尼亚的记忆，让她忘了不应该知晓的事情。随后，玛丽安娜致力于开发阿尼亚的潜能，并使其成为了第六骑士。 在R2第20集中，玛丽安娜为了弑神计划的实施再次控制了阿尼亚的身体，令C.C.解除对Code的封印，并带其前往神根岛。 在R2第21集中，玛丽安娜于进入遗迹前，救了刺杀皇帝未遂、因塌方而昏迷不醒的枢木朱雀。 种种迹象表明，她似乎想用黑色签字笔在朱雀脸上涂鸦，但是由于对方苏醒而作罢，并抱怨其“醒得太早了……”。之后，玛丽安娜通过遗迹进入C的世界，与绡鲁鲁皇帝会合，开始弑神计划。但最终由于鲁路修的愿望——“不要让时间停下脚步”，随着阿卡夏之剑的崩溃，她与绡鲁鲁皇帝一同被C的世界吞噬，等同于死亡。