没有结局的结局，牧云笙虽然当了皇帝，但是他无心当，和龙锦焕出走去找盼兮，穆如寒江随流放的穆如家族到了焕海，遇到了苏语凝，他不愿拖累苏语凝，假装不喜欢她，把她赶走了，说好的皇帝还没兑现，硕风和叶似乎明白了天下不是那么好得，传说也不是一定兑现的，慢慢放弃了追逐天下的念头，后边的剧情还有很多可以延伸，应该还有续集可等待。
在电视剧《海上牧云记》的结局中，穆如一族被发配至殇洲，牧云笙和龙锦焕踏上了寻找盼兮的旅程，虞心忌杀了合戈，南枯皇后自刎，南枯月漓自杀之后被秦玉丰救下，但是醒来后的南枯月漓变成了一个傻子。
《九州·海上牧云记》的结局是苏语凝与穆如寒江没有在一起，牧云笙和穆如寒江都成了皇帝。牧云笙对皇位其实并不是非常在意，他觉得不管谁当皇帝，对他来说都是可以的，然而他帝王的命运不是说改就能改的，这样的结局对于穆如寒江亦是如此。
九州·海上牧云记剧情介绍
端朝末年，牧云皇族和穆如世家三百年的盟约因为一个预言而冰裂。预言说，六皇子牧云笙（黄轩饰）执剑则天下大乱，而穆如寒江（窦骁饰）将成为未来的皇帝。以牧云栾（王千源饰）和牧云德（张晓晨饰）为代表的地方势力密谋趁机夺权，为此不惜与邪恶势力合作。太子牧云笙不爱江山不信天命，为追寻真爱宁愿牺牲权力地位。穆如寒江生于世家长于市井，喜欢自由，又想守护秩序，历经艰险磨难，终于回归家族。硕风和叶（周一围饰）在与穆如铁骑的战斗中失去了亲人和族人，经过了血与火的洗礼，生与死的诀别，人情的冷暖，权力的碰撞之后，他从一个复仇者成长为铁沁之王。